Thực hiện chỉ đạo của Bộ Quốc phòng, bắt đầu từ 19h tối 28/3, lực lượng Binh chủng Hoá học đã cử lực lượng đến phun tiêu độc toàn bộ không gian của Bệnh viện Bạch Mai.

Thông tin ban đầu, chỉ huy trưởng lực lượng là Đại tá Phạm Xuân Hưng, Phó Tư lệnh Binh chủng Hoá học. Binh chủng đã điều động 10 trang thiết bị chuyên dùng gồm: các xe đặc chủng CDS 1000, Saniz 921, trạm tiêu độc đa năng, xe tẩy độc diệt trùng và nhiều trang thiết bị khác cùng các loại hoá chất chuyên dùng để phục vụ tiêu độc.